Google Android - это несложно

Я знаю, что передать данные в сервис можно через intent, но насколько я понял в intent мы данные кладем до старта Service, а после в Service мы работаем с уже имеющимися в intent данными. Отправку данных из Service в Activity я настроил с помощью Handler, а как сделать отправку данных из Activity уже после запуска?

должно помочь http://developer.android.com/guide/comp ... vices.html

Например
startService(new Intent(this, service.class).putExtra("time", 5));

Если сервис запущен, то выполнится onStartCommand в уже работающем сервисе